微生物群落是自然界中普遍存在的一类基本单元或功能单元，其内部既有不同种类的菌群，又有自己独特的营养与代谢模式，是生态系统的有机组成部分。在一定程度上，微生物种群的发育促进了生物体的发育。由于大部分食物都是无法完全消化和吸收的，这时就需要体内的微生物来帮助身体合成维生素和其他必需物质，从而有助于食物的消化。此外，已有文献表明，肠道微生物群落对人体的消化功能，物质代谢，以及能量吸收、免疫功能等方面都有重要的调控作用。人类的肥胖症及与其相关的炎症反应、抑郁、炎症性肠病等，均与肠道微生态失衡密切相关。因此，对机体内与之有关的菌群的认识，对于预防和治疗各种慢性病、维持机体健康具有重要意义。

1.微生物群落及其与机体健康的关系-肠道微生物群落

在人类基因组中，大约有23000个蛋白编码基因，而在肠道微物群中，蛋白质编码基因大约有3000万个，超过人类基因组编码基因数的100倍。同时，人类肠道内含有微生物的基因约300万个，是人体基因数量的150倍；微生物种类为15000~36000种左右，总重量共达1.5kg左右，相当于人类粪便中生物量的50%。肠道微生物群是一种较特殊且不可或缺的机体“器官”，对机体健康起着至关重要的作用；据大量相关研究报道显示，肠道微生物群对机体的药理代谢、能量代谢、免疫功能，以及机体的术后功能恢复等均具有重要影响，在它们的作用下，机体内的食物、药物均能够得到较好消化和排出，包括外源复合物，合成维生素，以及抑制病原体的入侵等，同时还会对大脑活动、机体免疫系统的发育产生影响，甚至还会调节机体的情绪行为，如对自闭症的病理产生影响等。

2.肠道微生物群落与机体代谢疾病的关系－肥胖和糖尿病

目前，肥胖症、糖尿病等代谢性疾病已严重威胁到人们的身体健康，因此，探讨肠道微物群落与脂肪代谢的关系具有十分重要的意义。虽然肥胖的本质是高热量摄入，但越来越多的研究提示，肠道菌群的变化也是导致机体能量失衡的重要因素。有关研究资料显示，肥胖症患者肠道中的拟杆菌、厚壁菌的丰度存在明显变化：拟杆菌减少50%，厚壁菌增加50%，而此现象在正常体态人机体中明显变化，简单来说，也就是肥胖者肠道中拟杆菌门的相对比例明显减少，而当肥胖者摄入低卡路里食物进行减重后，这一比例又神奇地提高。由此可见，肠道菌群是影响宿主对食物中能量吸收的主要原因之一。

上海交通大学生命科学系的赵立平教授曾多次在国内知名期刊上发表关于肠道菌群与肥胖症之间关系的论文，他认为，人体中存在着某些有害菌群，这些有害菌群对机体的能量代谢产生了影响，从而引起了机体的炎症反应。美国华盛顿大学基因科学研究中心的负责人杰弗里-戈登领导他的研究小组，分别将一群肥胖老鼠、一群瘦弱老鼠肠道里的菌群转移到一群肠道内无菌群的老鼠身上进行实验后发现，一段时间后，相比于转移了瘦弱老鼠肠道菌群的无菌群老鼠而言，转移了肥胖老鼠肠道菌群的无菌群老鼠身上的脂肪增长更多。这一结果也证实了肠道微生物群会对人体状态产生一定程度的影响。

3.其他部分慢性疾病与微生物群落的关系

可见,对肠道微生物群落结构的调节控制，对于慢性肠道疾病有潜在的治疗价值。多种慢性病均与肠道菌群失衡相关。有研究显示，肠易激综合症:肠道菌群失衡是IBS发病的重要原因。同时发现，与正常人群比较， IBS患者肠道菌群中的乳酸杆菌、拟杆菌等菌群存在显著差异，而拟球梭菌的菌群变化不大，但总菌群变化不显著；此外，有研究表明：大肠癌的发生、发展与肠道菌群密切相关，且通过荧光原位杂交技术分析，显示梭菌（coli）与结直肠癌（coli）的发生可能相关。可见，调控肠道微生物群落结构，可有效防治慢性肠道疾病的重要手段，对慢性肠道疾病的有效治疗潜在重要促进价值。

综上，机体中的微生物群落丰富，如肠道微生物，而肠道微生物与多种代谢综合征、慢性疾病等的发生密切相关。所以，充分了解机体微生物群落在各种相关疾病发展中的影响及作用，不仅对如心血管病、风湿性关节炎、阿尔兹海默病等慢性病、代谢综合征的有效治疗有重要意义，而且对其他慢性疾病的预防和治疗，以及保持身体健康也有重要意义。